説明：B.1.617バリアントとインドでのCovid-19の急増

ゲノムシーケンシングデータは、マハラシュトラ州のサンプルの61％で「二重変異体」の証拠を示しています。しかし、この新しい変種がインドの継続的な急増を推進しているかどうかは、より多くのデータが利用可能になった後でないと言えません。

医療従事者は、ニューデリーのシェナイバンケットホールでベッドを準備します。このホールは、Covid-9患者のための一時的な病棟に改造されました。 （エクスプレス写真：アミット・メーラ）

先週マハラシュトラ州の地区研究所との会議で、国立ウイルス研究所（NIV）は、今年1月から3月の間に収集された361のゲノム配列サンプルの内訳を示す限られたデータを共有しました。

からの見出しの発見 解析 ：サンプルの220（ほぼ61％）で二重変異の存在が検出されました。この二重バリアントは先週、B.1.617バリアントとして分類されました。

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B.1.617とは何ですか？

SARS-CoV-2のB.1.617変異体は、E484QとL452Rの2つの変異を持っています。両方とも他の多くのコロナウイルス変異体に別々に見られますが、インドで初めて一緒に報告されました。

2つの変異は、ウイルスのスパイクタンパク質に見られます。スパイクタンパク質は、ウイルスがそれ自体をヒト細胞の受容体に結合させ、宿主細胞に侵入するのを助けます。

E484Q変異は、コロナウイルスの英国（系統B.1.1.7）および南アフリカ（B.1.351）変異体に見られる変異であるE484Kに類似しています。

L452R変異は、カリフォルニアの急速に広がる変異体（B.1.427およびB.1.429）で発見されています。スパイクタンパク質とヒト細胞のACE2受容体との結合力を高め、より伝染性を高めることができます。 L452Rは、ウイルス複製を強化する可能性もあります。

一緒に、E484QとL452Rはより感染性が高く、抗体を回避することができます。

B.1.617はどこで見つかりましたか？

データは限られています。それはマハラシュトラから最初に報告されました。 1月には、さまざまな地区から19のサンプルがシーケンスされ、4つでB.1.617が見つかりました。 2月には、18の地区から234のサンプルがシーケンスされ、少なくとも16の地区からの151のサンプルにこのバリアントが含まれていました。そして3月には、94のサンプルのうち65がそれを持っていました。

これまでのところ、アムラヴァティ、ナグプール、アコラ、ワルダ、プネ、ターネ、オーランガバード、チャンドラプルの各地区は、B.1.617の存在を示す強力な証拠を示しています。他の地区ではシーケンスされたサンプルが少なく、一部の地区でバリアントが見つかりました。より多くのサンプルのシーケンスは保留中です。

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この亜種はより毒性がありますか？

これまでのところ証拠はありません。科学的証拠を生成するには、臨床経験をゲノム配列データと組み合わせる必要がありますが、ほとんどの患者は自宅隔離で行うことができます。医師からの臨床的逸話は、変異体がより速く広がり、より感染性が高く、家族全員に感染する可能性があることを示唆していますが、毒性が低く、劇的に多くの入院を引き起こすことはありません。

ほとんどの患者は無症候性であり、それは良い兆候です。しかし、絶対数では、非常に多くのケースが健康インフラに負担をかけていると、マハラシュトラコビッドタスクフォースの専門家であるシャシャンクジョシ博士は述べています。

それはどのくらい広がりましたか？

国立疾病管理センター（NCDC）の所長であるSujeet Singh博士は、マハラシュトラ州からのサンプルはこれまでにほとんど配列決定されておらず、二重変異体がどれほど普及しているかについて決定的な結論を出すには時期尚早であると指摘しました。しかし、中央政府は3月に、マハラシュトラ州の15〜20パーセントのサンプルにこの亜種が含まれていると報告しました。最新のシーケンスデータに基づくと、この数は現在60％を超えていることがわかります。

マハラシュトラ州の臨床医と地区管理者は、第1波とは異なり、第2波では家族全員が感染していると報告しています。これは、家庭内での物理的な距離と隔離の対策が不十分であるか、ウイルスがより感染しやすくなっていることを示している可能性があります。

B.1.617は、Covid-19の症例で進行中の急増を引き起こしている可能性がありますか？

ベッロールのクリスチャンメディカルカレッジの微生物学教授であるガンガンディープカン博士は、この変異体を含む60.9％のサンプルは、突然変異と急増の間に関連性を示した可能性が高いと述べました。ただし、正確な答えを得るには、Covid-19サンプルの少なくとも1％が毎週シーケンスする必要があります。現在、インドでは1日あたり1万ルピー以上の症例がテストされており、これは毎日約1,000のゲノム配列に相当します。

また、人が感染できる人の数と、RT-PCRサイクルのしきい値を確認する必要があります。ライブトラッキングを行う必要があります。カン博士によると、1月のデータは4月にはほとんど価値がないという。

ソーニーパットのアショカ大学とチェンナイ数理科学研究所の教授であるGautamMenon博士は、次のように述べています。症例の増加がこの二重変異変異によるものであることを示唆するには、より多くの時点が必要です。たとえば、3月30日のサンプルでこの亜種の30％が検出され、4月14日のサンプルで40％が検出されたと言えば、新しい亜種が病気の蔓延を支配していることを示しています。

メノン博士も、データの透明性を高める必要性を強調しました。ますます可能性は低いものの、症例が以前の株に関連している可能性もあると彼は述べた。増加が新しい亜種にどの程度起因するかを知らない限り、古い株によるCovidに適した行動の緩和が増加を引き起こしたのか、それとも新しい亜種の感染力の増加が原因であるのかを決定的に判断することはできません。

CSIR-IGIBの主任科学者であるVinodScaria教授は、これらの変種が第2波の急増を推進していると断定的に言うことはできないことに同意しました。しかし、証拠は、少なくともいくつかの州では、B.1.1617系統が優勢であり、症例の増加に寄与している可能性があることを示唆していると彼は述べた。この系統は、6つのスパイクタンパク質変異体を含む15の遺伝的変異体によって定義されます。これらのうちの2つ（E484QとL452R）は、免疫回避と感染力の増加に関与している、とScaria教授は述べた。

亜種はワクチンを回避できますか？

繰り返しますが、データは限られています。一部の人々は実際に最初の投与後に感染していますが、彼らのサンプルがゲノム配列決定のために送られたかどうかについてのデータはありません。

南アフリカの亜種は免疫応答を逃れる能力が高いことを私たちは知っています。英国の亜種が最も感染しやすいことを私たちは知っています。しかし、結論を出すためにデータをまとめていないため、これまでのところB.1.617については何も知りません。

メノン博士は、ワクチンは感染を防ぐことは期待されていませんが、重度の病気や死を確実に防ぐことを強調しました。これは、新しいバリアントでも当てはまると予想されます。 Covid-19に対処するための中長期的な解決策は、人々にワクチンを接種することだけです。

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