説明：コロナウイルス（COVID-19）を検出するための5つのステップ
このプロセスは、NIMHANSの神経ウイルス学部の上級教授兼ヘッドであるVRavi博士によってIndianExpressに説明されました。
2020年3月17日に撮影されたこの図のコロナウイルス（COVID-19）でラベル付けされた試験管に偽の血液が見られます。（ロイター） NIMHANSの神経ウイルス学部の上級教授兼ヘッドであるVRavi博士は、コロナウイルスを検出するプロセスを次のように説明しています。 このウェブサイト 。 5つのステップは次のとおりです。
収集と輸送
テストセンターは、鼻腔と喉の奥（咽頭）から綿棒を採取し、ウイルスの崩壊を防ぐために平衡塩類とアルブミンを含むウイルス輸送培地にサンプルを入れます。その後、サンプルは冷蔵保管されてテストラボに輸送されます。
ウイルスRNAの抽出
SARS-CoV（2002-03年に中国で出現）、MERS-CoV（2012年にサウジアラビアで出現）、またはCOVID-19パンデミックを引き起こした現在のSARS-CoV-2などのコロナウイルスは、 、一本鎖RNAゲノム。テストラボでは、市販のキット（QIAGENなどの企業が製造したキットなど）を使用して、サンプルからRNAを抽出します。
RNAをPCRミックスに入れる
抽出されたRNAは、ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）ミックスに追加されます。これには、RNAをDNAに変換する「逆転写酵素」酵素を含む「マスターミックス」が含まれます。マスターミックスには、DNA、ヌクレオチド、およびマグネシウムなどの他の要素のコピーを作成する酵素であるTaqポリメラーゼが含まれています。これらの要素は、DNAを増幅するために必要です。
PCRミックスには、「プライマー」や「プローブ」などの「試薬」も含まれています。プライマーは、コピーされるDNAと結合するように設計された特定のDNA鎖です。プローブは、DNAサンプルの特定の配列を検出するために使用されます。 WHOは、COVID-19の検査に特定のプライマーとプローブを推奨しています。
最後に、PCRミックスはハウスキーピング遺伝子で構成されています。これは、サンプルが適切に収集され、RNAが抽出されたことを確認するために使用される通常のヒト遺伝子（RNase P）です。
ウイルスDNAの増幅
PCRミックス中のサンプルは、チューブまたはプレートに入れられ、PCRプロセスの実行に使用されるサーマルサイクラーマシンに入れられます。
まず、RNAがDNAに変換されます。次に、遺伝子をコピーするプロセスが開始されます。サーマルサイクラーは、サンプルとの混合物を加熱および冷却し、3つの温度を交互に繰り返します。つまり、DNAを溶かして2つの鎖を分離し、プライマーをDNAに結合させ、新しい鎖を合成するために、すべて1サイクル以内に続きます。分。サーマルサイクラーは、ウイルスをチェックするためにDNAを増幅するために、このようなサイクルを30〜40回実行します。
コントロールに対するテスト
増幅されたDNAは、通常プラスミドにクローン化されたウイルスの遺伝子で構成されるポジティブコントロールと、以前にウイルスに対してネガティブにテストされた「既知の」サンプルであるネガティブコントロールに対してテストされます。
RNase Pは増幅を示し、ポジティブコントロールはポジティブ、ネガティブコントロールはネガティブである必要があります。そうすれば、検体で得られる結果が何であれ、正しい結果になると神経ウイルス学者のVRavi博士は述べています。結果がリリースされる前にテストが有効であるためには、特定の「有効性基準」が満たされている必要があります。
ハウスキーピング遺伝子（RNase P）が陽性、陽性対照が陽性、陰性対照が陰性であり、サンプルがPCR陽性の結果を示さない場合、サンプルはSARS-CoV-2ウイルスRNAに対して陰性であると宣言されます。 PCRの結果が陽性の場合、患者はCOVID-19に感染しています。
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